This is an ordination plot from a 15N2 DNA-SIP experiment. Each panel has independent brushing allowing different regions to be highlighted.
Last active
August 29, 2015 14:11
-
-
Save chuckpr/971ef64e3f468cf97e12 to your computer and use it in GitHub Desktop.
N-SIP ordination w brushing
This file contains hidden or bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| Axis_1 | Axis_2 | X.SampleID | BarcodeSequence | BiocrustType | BiogeographicalRegion | Carbonate | Clay | Conductivity | DayCollected | Density | Description | Elevation | Gypsum | LinkerPrimerSequence | MeanAnnualPrecipitation | MeanAnnualTemp | MeanSummerTemp | MeanWinterTemp | OrganicMatter | PrecipitationBimodalityIndex | ReversePrimer | Sand | SoilOrder | Treatment | biome | collection_date | collection_time | collection_timezone | continent | country | crust_or_below | depth | elevation | feature | latitude | location | longitude | material | mgrast_id | ph | samp_collect_device | samp_size | sample_name | site | soil_type | study | temperature | pc1.pct | pc2.pct | strip | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| -0.40649261971313 | -0.031418244235544 | G2F19 | TCACGTACCA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7135416 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.333102033250776 | -0.00211097097417971 | G1F14 | TCAGAGAGAG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7244686 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.433671685531214 | 0.0118648500866266 | G2F18 | TCACGTAGCT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7190051 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.0928393080426953 | 0.117988364678455 | G2F14 | TCAGAGCAGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7353956 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.0913803772177918 | -0.0422867038342486 | G1F8 | TCAGACAGAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7627131 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.119505145115432 | -0.26463256723891 | G1F18 | TCACGAGAAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7026146 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.294305042049871 | 0.0841970977312218 | G1F13 | TCACTGAGAG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7299321 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.306799253083662 | 0.0396577815054156 | G2F17 | TCACGTGTTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7222832 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.272864139390086 | -0.00119535711592649 | G1F23 | TCACTCTCTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6774825 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.168258458000867 | 0.121333474332618 | G1F12 | TCACTGTCTC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7364883 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.292368545699469 | -0.0365875097586573 | G2F20 | TCACGTCATG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7102635 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.0258337041424574 | 0.0606567563247109 | G2F32 | TCAGAGCTCT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6654628 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.0984829182475817 | -0.0959601114994448 | G1F26 | TCACTCCTGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6643701 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.313447988897677 | -0.0188923325573738 | G2F16 | TCACTCGTGA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7255613 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.205567556644932 | -0.153122150908804 | G1F24 | TCACGTCTTC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6742044 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.105833422717802 | -0.111693661072576 | G1F10 | TCAGACGAGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.748508 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.139134464514004 | 0.0203647875095391 | G1F7 | TCAGAGACAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7659912 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.046757192838267 | 0.153090275339654 | G2F12 | TCAGACCACT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7430445 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.472661894610853 | -0.0192180480101857 | G1F15 | TCACGATCCA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7200978 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.341283420459196 | 0.0857185278758302 | G2F26 | TCACTGACAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6884095 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.331937677466762 | -0.106340303067452 | G1F20 | TCACGATCGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.693873 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.388613455144624 | 0.00595728447975696 | G2F25 | TCACTCTGTC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6927803 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.100601608496438 | -0.0712159552610597 | G2F15 | TCACTCGTCT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7310248 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.322959395886209 | -0.0409688894288013 | G2F24 | TCACTCAGTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6960584 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.154736126085428 | -0.0409830090464787 | G2F31 | TCAGACTCAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6687409 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.286451349274404 | 0.107108336406422 | G2F27 | TCACTGCACA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6862241 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.395057516970369 | -0.13475024062858 | G1F17 | TCACGACAAG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7091708 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.363335678344246 | -0.117361637264716 | G1F21 | TCACGTCAAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6905949 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.100310671627648 | -0.217142056952015 | G1F19 | TCACGAGATG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6982438 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.276902563205291 | 0.00866840192935864 | G1F9 | TCACTCCTCA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7539715 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.116963872957131 | 0.315888511029286 | G2F11 | TCACTGTGTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7463226 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.1627418987777 | 0.000957009950813828 | G2F30 | TCAGACGACA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6731117 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.0850956272249087 | 0.252692861491682 | G2F10 | TCACTGTGAC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7506934 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.39582788586767 | -0.0735131177405952 | G1F16 | TCACGAAGGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7146343 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.00263433379644025 | 0.358608421857838 | G2F8 | TCAGACAGTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7616204 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.169218465898696 | 0.0275000528412536 | G2F29 | TCAGACCTGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6763898 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.109019409197921 | -0.172664880845672 | G2F21 | TCAGACCAGA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7080781 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.176364180000363 | -0.206617109990071 | G2F22 | TCACGTTCCT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7037073 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.226554418498924 | -0.145133156254319 | G2F23 | TCACGTCTAG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7004292 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.0197034929661984 | 0.189676178802241 | G2F9 | TCAGAGTGTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7561569 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.165026113065469 | -0.175573494362677 | G1F25 | TCACGTTGGT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6709263 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.150178347843339 | -0.0568261225993968 | G1F11 | TCAGAGACTG | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7419518 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.222156069797099 | 0.00870770382562876 | G2F28 | TCAGACCTCA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6807606 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.373555654784466 | -0.0486042645245093 | G1F22 | TCAGACTGTC | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.6840387 | gradient1 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.0489768082965781 | 0.272320405838137 | G2F7 | TCAGACGTCT | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7659912 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| 0.0880601314175851 | 0.141854811335705 | G2F13 | TCAGACGTGA | NA | NA | NA | NA | NA | 2 | 1.7397664 | gradient2 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.33782185531941 | 0.104717876591212 | Day 2 | |
| -0.44013509209346 | -0.0243681368633192 | G4F20 | TCACGTTCGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7135416 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.293216217094097 | 0.0801848065263688 | G3F12 | TCACGAGTAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7233759 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.122805279159483 | 0.0991217524323513 | G3F8 | TCACTCACTC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7430445 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.361333931247935 | 0.0514034768175543 | G3F14 | TCACGACATC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7135416 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.331836122085087 | -0.0133239547645821 | G3F13 | TCACGATGCT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7211905 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.193429818261015 | -0.150277505690529 | G4F32 | TCACTGTCAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6632774 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.229482115370792 | 0.138366095099255 | G3F11 | TCACTCGACA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7255613 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.280998852187564 | -0.0556464798025061 | G4F31 | TCAGAGTGAC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6709263 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.094458757769634 | 0.0762881886370218 | G3F3 | TCAGACACTC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7670839 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.157108338834913 | 0.116404193258047 | G3F9 | TCACGTGAAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7364883 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0581068983866916 | -0.214976890582257 | G4F15 | TCACTGCTGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7310248 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0609110016410121 | 0.0275631180996542 | G3F5 | TCACTCTGAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7572496 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.366027349839593 | 0.0329093973578377 | G4F21 | TCACGTAGGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7080781 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.163859075098452 | 0.167899549796864 | G3F15 | TCACTGAGTC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7080781 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.00346753733452458 | -0.282811774836832 | G4F8 | TCAGACACAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7627131 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.103219919023396 | -0.0810197036481845 | G4F11 | TCAGAGGACT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.748508 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.0528164419494539 | 0.117665024057575 | G3F6 | TCAGAGAGTC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7528788 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.136282166844983 | 0.305006487859519 | G3F17 | TCACGACTAC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6971511 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.064682023902733 | -0.191566203651154 | G4F10 | TCAGACTGAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7506934 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.322465208515336 | 0.0799572192439561 | G3F21 | TCACTCGAGT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6785752 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.375712782568699 | -0.0568834314940102 | G4F19 | TCACTCCACT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7146343 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.172194976498319 | 0.217153548616486 | G3F10 | TCACGTACGT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7321175 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0767495466997399 | 0.0536953582052075 | G3F4 | TCACTCACAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7627131 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0663864938274517 | -0.0966263884403754 | G4F12 | TCAGAGGAGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7397664 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.226345607407706 | -0.0832603391829344 | G4F17 | TCACTGGACT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7222832 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.348431002181732 | 0.140258870596442 | G3F20 | TCACGAGTTC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6840387 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.446720805589353 | -0.0518044920032196 | G4F27 | TCACTGGTCA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6851314 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.342892360505916 | -0.044870399279443 | G4F30 | TCACTGGTGT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.672019 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.165966936900942 | -0.0042453872414413 | G3F7 | TCAGAGCACA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.748508 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.384609450348485 | 0.0102570594685849 | G4F25 | TCAGAGGTGT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6916876 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.260576266591271 | -0.157437384515452 | G4F26 | TCAGAGTCAG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.693873 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.106754584175019 | -0.199080561558474 | G4F7 | TCAGAGCTGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7659912 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.149953324252367 | 0.14058084932053 | G3F24 | TCACTCAGAC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6654628 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.287908824731765 | -0.0453770776080855 | G4F18 | TCAGAGGTCA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7190051 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.077812746450421 | 0.0658567458965001 | G4F23 | TCACTCCAGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6993365 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0796473064378105 | -0.200320940967266 | G4F14 | TCACTGCTCT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7343029 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.394392232943941 | -0.0492169486606406 | G4F29 | TCAGAGTCTC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6763898 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.168543751759863 | -0.111082561468526 | G4F16 | TCACTGACTG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.726654 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.288642102684226 | 0.0473225934502862 | G4F22 | TCACTGGAGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7037073 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0609511958306697 | -0.258980454816453 | G4F9 | TCAGACTCTG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7561569 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.110784480806567 | 0.194343058214141 | G3F16 | TCACGATGGA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.7015219 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.170294542109662 | 0.218752497245659 | G3F23 | TCACGTGTAC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6687409 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| -0.0115725496110034 | -0.235492424070219 | G4F13 | TCACTGCAGT | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.737581 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.233476163890922 | 0.112073663380545 | G3F22 | TCACGTGATC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.672019 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.185960107707729 | 0.0451478281770727 | G4F24 | TCACGTTGCA | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6960584 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.320176740260153 | 0.133745053581926 | G3F18 | TCACGACTTG | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6927803 | gradient3 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | control | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 | |
| 0.350769944311149 | -0.063286994193481 | G4F28 | TCACTCTCAC | NA | NA | NA | NA | NA | 4 | 1.6851314 | gradient4 | NA | NA | CAGGACTACHVGGGTWTCTAAT | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | label | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NSIP | NA | 0.395651691173882 | 0.12911008318309 | Day 4 |
This file contains hidden or bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| <html lang="en"> | |
| <head> | |
| <style> | |
| .axis path { | |
| stroke: black; | |
| shape-rendering: crispEdges; | |
| stroke-width: 2.5; | |
| } | |
| .axis line { | |
| shape-rendering: crispEdges; | |
| stroke: lightgrey; | |
| } | |
| .axis text { | |
| font-size: 20px; | |
| font-family: sans-serif; | |
| } | |
| .point.hidden { | |
| fill-opacity: 0.10; | |
| } | |
| .brush { | |
| fill: lightgray; | |
| fill-opacity: 0.3; | |
| stroke: #151515; | |
| } | |
| </style> | |
| <svg class="chart"></svg> | |
| </head> | |
| <body> | |
| <script src="http://d3js.org/d3.v3.min.js"></script> | |
| <script src="scatter.js"></script> | |
| </body> |
This file contains hidden or bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| margin = {top: 50, bottom : 100, left : 100, right : 50, mid: 80} | |
| width = 1000 - margin.left - margin.right | |
| height = 500 - margin.top - margin.bottom | |
| svg = d3.select ".chart" | |
| .attr "width", width + margin.left + margin.right | |
| .attr "height", height + margin.top + margin.bottom | |
| chart = svg | |
| .append "g" | |
| .attr "transform", "translate(" + margin.left + "," + margin.top + ")" | |
| half = margin.left + width/2 | |
| console.log half | |
| chart2 = svg | |
| .append "g" | |
| .attr "transform", "translate(" + half + "," + margin.top + ")" | |
| type = (d) -> | |
| d.Axis_1 = +d.Axis_1 | |
| d.Axis_2 = +d.Axis_2 | |
| d.Density = +d.Density | |
| d | |
| x = d3.scale.linear() | |
| .range [0, width / 2 - margin.mid] | |
| y = d3.scale.linear().range [height, 0] | |
| r = d3.scale.linear() | |
| .range [3, 10] | |
| c = d3.scale.category10() | |
| xAxis = d3.svg.axis() | |
| .scale x | |
| .orient "bottom" | |
| .ticks 5 | |
| .tickSize -height, 0, 0 | |
| yTickEnd = (width - 2 * margin.mid) / 2 | |
| console.log yTickEnd | |
| yAxis = d3.svg.axis() | |
| .scale y | |
| .orient "left" | |
| .ticks 5 | |
| .tickSize -yTickEnd, 0, 0 | |
| drawAxis = (selection, axis, translate) -> | |
| ax = selection | |
| .append("g") | |
| .attr "class", "axis" | |
| .attr "transform", translate | |
| .call axis | |
| ax | |
| d3.csv("readme.csv", type, (data) -> | |
| data2 = data.filter (d) -> if d.DayCollected == "2" then true else false | |
| data4 = data.filter (d) -> if d.DayCollected == "4" then true else false | |
| x.domain [d3.min(data, (d) -> d.Axis_1) - 0.05, | |
| d3.max(data, (d) -> d.Axis_1) + 0.05] | |
| y.domain [d3.min(data, (d) -> d.Axis_2) - 0.05, | |
| d3.max(data, (d) -> d.Axis_2) + 0.05] | |
| r.domain [d3.min(data, (d) -> d.Density), d3.max(data, (d) -> d.Density)] | |
| ax = drawAxis(chart, xAxis, "translate(0," + height + ")") | |
| ax2 = drawAxis(chart, yAxis, "translate(0,0)") | |
| ax3 = drawAxis(chart2, xAxis, "translate(0," + height + ")") | |
| ax4 = drawAxis(chart2, yAxis, "translate(0,0)") | |
| [ax, ax3].forEach( (a) -> | |
| a.append("text") | |
| .attr "x", x(0) | |
| .attr "y", margin.bottom / 2 | |
| .attr "text-anchor", "middle" | |
| .text("PC1") | |
| ) | |
| [ax2, ax4].forEach( (a) -> | |
| a.append("text") | |
| .attr "transform", () -> "translate(" + -margin.left/2 + "," + height/2 + ")rotate(-90)" | |
| .attr "text-anchor", "middle" | |
| .text("PC2") | |
| ) | |
| update = (data, chart) -> | |
| points = chart.selectAll ".point" | |
| .data data #, (d) -> d.Sample | |
| points.enter().append "circle" | |
| .attr "class", "point" | |
| .attr "cx", (d) -> x d.Axis_1 | |
| .attr "cy", (d) -> y d.Axis_2 | |
| .attr "r", (d) -> r d.Density | |
| .attr "fill", (d) -> c d.Treatment | |
| points.exit().remove() | |
| update(data2, chart) | |
| update(data4, chart2) | |
| brushmove = () -> | |
| e = brush.extent() | |
| chart | |
| .selectAll ".point" | |
| .classed "hidden", (d) -> e[0][0] > x(d.Axis_1) ||\ | |
| x(d.Axis_1) > e[1][0] ||\ | |
| e[0][1] > y(d.Axis_2) ||\ | |
| y(d.Axis_2) > e[1][1] | |
| brushmove2 = () -> | |
| e = brush2.extent() | |
| chart2 | |
| .selectAll ".point" | |
| .classed "hidden", (d) -> e[0][0] > x(d.Axis_1) ||\ | |
| x(d.Axis_1) > e[1][0] ||\ | |
| e[0][1] > y(d.Axis_2) ||\ | |
| y(d.Axis_2) > e[1][1] | |
| brushend = () -> | |
| if brush.empty() | |
| chart.selectAll(".hidden") | |
| .classed("hidden", false) | |
| brushend2 = () -> | |
| if brush2.empty() | |
| chart2.selectAll(".hidden") | |
| .classed("hidden", false) | |
| brush = d3.svg.brush() | |
| .x d3.scale.ordinal().range [0, width / 2 - margin.mid] | |
| .y d3.scale.ordinal().range [height, 0] | |
| .on "brush", brushmove | |
| .on "brushend", brushend | |
| brush2 = d3.svg.brush() | |
| .x d3.scale.ordinal().range [0, width / 2 - margin.mid] | |
| .y d3.scale.ordinal().range [height, 0] | |
| .on "brush", brushmove2 | |
| .on "brushend", brushend2 | |
| chart.append "g" | |
| .attr "class", "brush" | |
| .call brush | |
| chart2.append "g" | |
| .attr "class", "brush" | |
| .call brush2 | |
| ) |
This file contains hidden or bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| // Generated by CoffeeScript 1.8.0 | |
| var c, chart, chart2, drawAxis, half, height, margin, r, svg, type, width, x, xAxis, y, yAxis, yTickEnd; | |
| margin = { | |
| top: 50, | |
| bottom: 100, | |
| left: 100, | |
| right: 50, | |
| mid: 80 | |
| }; | |
| width = 1000 - margin.left - margin.right; | |
| height = 500 - margin.top - margin.bottom; | |
| svg = d3.select(".chart").attr("width", width + margin.left + margin.right).attr("height", height + margin.top + margin.bottom); | |
| chart = svg.append("g").attr("transform", "translate(" + margin.left + "," + margin.top + ")"); | |
| half = margin.left + width / 2; | |
| console.log(half); | |
| chart2 = svg.append("g").attr("transform", "translate(" + half + "," + margin.top + ")"); | |
| type = function(d) { | |
| d.Axis_1 = +d.Axis_1; | |
| d.Axis_2 = +d.Axis_2; | |
| d.Density = +d.Density; | |
| return d; | |
| }; | |
| x = d3.scale.linear().range([0, width / 2 - margin.mid]); | |
| y = d3.scale.linear().range([height, 0]); | |
| r = d3.scale.linear().range([3, 10]); | |
| c = d3.scale.category10(); | |
| xAxis = d3.svg.axis().scale(x).orient("bottom").ticks(5).tickSize(-height, 0, 0); | |
| yTickEnd = (width - 2 * margin.mid) / 2; | |
| console.log(yTickEnd); | |
| yAxis = d3.svg.axis().scale(y).orient("left").ticks(5).tickSize(-yTickEnd, 0, 0); | |
| drawAxis = function(selection, axis, translate) { | |
| var ax; | |
| ax = selection.append("g").attr("class", "axis").attr("transform", translate).call(axis); | |
| return ax; | |
| }; | |
| d3.csv("readme.csv", type, function(data) { | |
| var ax, ax2, ax3, ax4, brush, brush2, brushend, brushend2, brushmove, brushmove2, data2, data4, update; | |
| data2 = data.filter(function(d) { | |
| if (d.DayCollected === "2") { | |
| return true; | |
| } else { | |
| return false; | |
| } | |
| }); | |
| data4 = data.filter(function(d) { | |
| if (d.DayCollected === "4") { | |
| return true; | |
| } else { | |
| return false; | |
| } | |
| }); | |
| x.domain([ | |
| d3.min(data, function(d) { | |
| return d.Axis_1; | |
| }) - 0.05, d3.max(data, function(d) { | |
| return d.Axis_1; | |
| }) + 0.05 | |
| ]); | |
| y.domain([ | |
| d3.min(data, function(d) { | |
| return d.Axis_2; | |
| }) - 0.05, d3.max(data, function(d) { | |
| return d.Axis_2; | |
| }) + 0.05 | |
| ]); | |
| r.domain([ | |
| d3.min(data, function(d) { | |
| return d.Density; | |
| }), d3.max(data, function(d) { | |
| return d.Density; | |
| }) | |
| ]); | |
| ax = drawAxis(chart, xAxis, "translate(0," + height + ")"); | |
| ax2 = drawAxis(chart, yAxis, "translate(0,0)"); | |
| ax3 = drawAxis(chart2, xAxis, "translate(0," + height + ")"); | |
| ax4 = drawAxis(chart2, yAxis, "translate(0,0)"); | |
| [ax, ax3].forEach(function(a) { | |
| return a.append("text").attr("x", x(0)).attr("y", margin.bottom / 2).attr("text-anchor", "middle").text("PC1"); | |
| }); | |
| [ax2, ax4].forEach(function(a) { | |
| return a.append("text").attr("transform", function() { | |
| return "translate(" + -margin.left / 2 + "," + height / 2 + ")rotate(-90)"; | |
| }).attr("text-anchor", "middle").text("PC2"); | |
| }); | |
| update = function(data, chart) { | |
| var points; | |
| points = chart.selectAll(".point").data(data); | |
| points.enter().append("circle").attr("class", "point").attr("cx", function(d) { | |
| return x(d.Axis_1); | |
| }).attr("cy", function(d) { | |
| return y(d.Axis_2); | |
| }).attr("r", function(d) { | |
| return r(d.Density); | |
| }).attr("fill", function(d) { | |
| return c(d.Treatment); | |
| }); | |
| return points.exit().remove(); | |
| }; | |
| update(data2, chart); | |
| update(data4, chart2); | |
| brushmove = function() { | |
| var e; | |
| e = brush.extent(); | |
| return chart.selectAll(".point").classed("hidden", function(d) { | |
| return e[0][0] > x(d.Axis_1) || x(d.Axis_1) > e[1][0] || e[0][1] > y(d.Axis_2) || y(d.Axis_2) > e[1][1]; | |
| }); | |
| }; | |
| brushmove2 = function() { | |
| var e; | |
| e = brush2.extent(); | |
| return chart2.selectAll(".point").classed("hidden", function(d) { | |
| return e[0][0] > x(d.Axis_1) || x(d.Axis_1) > e[1][0] || e[0][1] > y(d.Axis_2) || y(d.Axis_2) > e[1][1]; | |
| }); | |
| }; | |
| brushend = function() { | |
| if (brush.empty()) { | |
| return chart.selectAll(".hidden").classed("hidden", false); | |
| } | |
| }; | |
| brushend2 = function() { | |
| if (brush2.empty()) { | |
| return chart2.selectAll(".hidden").classed("hidden", false); | |
| } | |
| }; | |
| brush = d3.svg.brush().x(d3.scale.ordinal().range([0, width / 2 - margin.mid])).y(d3.scale.ordinal().range([height, 0])).on("brush", brushmove).on("brushend", brushend); | |
| brush2 = d3.svg.brush().x(d3.scale.ordinal().range([0, width / 2 - margin.mid])).y(d3.scale.ordinal().range([height, 0])).on("brush", brushmove2).on("brushend", brushend2); | |
| chart.append("g").attr("class", "brush").call(brush); | |
| return chart2.append("g").attr("class", "brush").call(brush2); | |
| }); |
Sign up for free
to join this conversation on GitHub.
Already have an account?
Sign in to comment