mamba-in-image.Dockerfile

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# Update and install OS packages
# https://docs.anaconda.com/anaconda/install/silent-mode/#linux-macos
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RUN curl --location --fail --remote-name \
        https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-Linux-x86_64.sh \
    && bash Miniforge3-Linux-x86_64.sh -b -p /opt/conda -u \
    && rm Miniforge3-Linux-x86_64.sh

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# Install the conda workflow environment
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ENV PATH=/opt/conda/bin:$PATH

COPY environment.yaml /root/

RUN mamba env create -f /root/environment.yaml

ENV PATH=/opt/conda/envs/my-custom-env/bin:$PATH

RUN find /opt/conda/ -name direct_url.json -delete