Create a patch file for specific files (.css & .tpl) and save it under the same tree

make_patch_files.sh

#!/bin/bash
FOLDER_OLD="phpboost_5-0"
FOLDER_NEW="phpboost_5-1"
FOLDER_PATCHES="./patches"

mkdir -p ${FOLDER_PATCHES}
for newfile in `find $FOLDER_NEW -type f -name "*.css" -o -name "*.tpl"`
do
sufix=${newfile#${FOLDER_NEW}/}
oldfile="${FOLDER_OLD}/${sufix}"

if [ -f $oldfile ]; then
    patchfile="${FOLDER_PATCHES}/$sufix.patch"
    if [ "`diff $oldfile $newfile`" != "" ]; then
        echo "Make patch ${patchfile}"
        mkdir -p `dirname $patchfile` && diff -dupN "$oldfile" "$newfile" > "$patchfile"
    fi
fi
done

patches_tree.txt

Example of patches between PHPBoost 5.0 and 5.1
root@patcher:~# tree patches/
patches/
├── articles
│   └── templates
│       ├── articles.css.patch
│       ├── ArticlesDisplayArticlesController.tpl.patch
│       ├── ArticlesDisplaySeveralArticlesController.tpl.patch
│       └── ArticlesFormFieldSelectSources.tpl.patch
├── BBCode
│   └── templates
│       ├── bbcode.css.patch
│       └── bbcode_editor.tpl.patch
├── calendar
│   └── templates
│       ├── CalendarAjaxEventsController.tpl.patch
│       ├── calendar.css.patch
│       └── CalendarDisplayEventController.tpl.patch
├── connect
│   └── templates
│       ├── connect_mini.css.patch
│       └── connect_mini.tpl.patch
├── contact
│   └── templates
│       ├── ContactController.tpl.patch
│       ├── contact.css.patch
│       ├── ContactFormFieldObjectPossibleValues.tpl.patch
│       └── ContactFormFieldRecipientsPossibleValues.tpl.patch
├── database
│   └── templates
│       ├── admin_database_management.tpl.patch
│       └── admin_database_tools.tpl.patch
├── download
│   └── templates
│       ├── download.css.patch
│       ├── DownloadDisplayDownloadFileController.tpl.patch
│       ├── DownloadDisplaySeveralDownloadFilesController.tpl.patch
│       ├── download_mini.css.patch
│       └── DownloadModuleMiniMenu.tpl.patch
├── faq
│   └── templates
│       ├── faq.css.patch
│       ├── FaqDisplaySeveralFaqQuestionsController.tpl.patch
│       └── FaqModuleMiniMenu.tpl.patch
├── forum
│   └── templates
│       ├── admin_ranks_add.tpl.patch
│       ├── admin_ranks.tpl.patch
│       ├── forum_bottom.tpl.patch
│       ├── forum.css.patch
│       ├── forum_edit_msg.tpl.patch
│       ├── forum_forum.tpl.patch
│       ├── forum_index.tpl.patch
│       ├── forum_membermsg.tpl.patch
│       ├── forum_moderation_panel.tpl.patch
│       ├── forum_post.tpl.patch
│       ├── forum_topic.tpl.patch
│       ├── forum_top.tpl.patch
│       └── forum_track.tpl.patch
├── gallery
│   └── templates
│       ├── admin_gallery_add.tpl.patch
│       ├── admin_gallery_config.tpl.patch
│       ├── admin_gallery_management.tpl.patch
│       ├── gallery_add.tpl.patch
│       ├── gallery_mini.tpl.patch
│       └── gallery.tpl.patch
├── install
│   └── templates
│       ├── install.css.patch
│       ├── main.tpl.patch
│       └── server-config.tpl.patch
├── kernel
│   └── lib
│       └── css
│           └── font-awesome
│               └── css
│                   └── font-awesome.css.patch
├── LangsSwitcher
│   └── templates
│       ├── langsswitcher.css.patch
│       └── langswitcher.tpl.patch
├── media
│   └── templates
│       ├── media_action.tpl.patch
│       ├── media.css.patch
│       └── media.tpl.patch
├── news
│   └── templates
│       ├── news.css.patch
│       ├── NewsDisplayNewsController.tpl.patch
│       ├── NewsDisplaySeveralNewsController.tpl.patch
│       └── NewsFormFieldSelectSources.tpl.patch
├── newsletter
│   └── templates
│       └── newsletter_mini.css.patch
├── online
│   └── templates
│       ├── OnlineHomeController.tpl.patch
│       └── OnlineModuleMiniMenu.tpl.patch
├── pages
│   └── templates
│       ├── action.tpl.patch
│       ├── admin_pages.tpl.patch
│       ├── explorer.tpl.patch
│       ├── index.tpl.patch
│       ├── pages.css.patch
│       └── post.tpl.patch
├── poll
│   └── templates
│       ├── admin_poll_add.tpl.patch
│       ├── admin_poll_config.tpl.patch
│       ├── admin_poll_management2.tpl.patch
│       ├── admin_poll_management.tpl.patch
│       ├── poll.css.patch
│       ├── poll_mini.tpl.patch
│       └── poll.tpl.patch
├── QuestionCaptcha
│   └── templates
│       └── QuestionCaptchaFormFieldQuestions.tpl.patch
├── ReCaptcha
│   └── templates
│       └── ReCaptcha.tpl.patch
├── search
│   └── templates
│       ├── admin_search.tpl.patch
│       ├── search.css.patch
│       ├── search_forms.tpl.patch
│       ├── search_mini.css.patch
│       ├── search_mini.tpl.patch
│       └── search_results.tpl.patch
├── shoutbox
│   └── templates
│       ├── ShoutboxAjaxMessagesBoxController.tpl.patch
│       ├── ShoutboxHomeController.tpl.patch
│       ├── shoutbox_mini.css.patch
│       └── ShoutboxModuleMiniMenu.tpl.patch
├── sitemap
│   └── templates
│       └── export
│           └── sitemap.xml.tpl.patch
├── stats
│   └── templates
│       ├── admin_stats_management.tpl.patch
│       ├── stats.css.patch
│       ├── stats_mini.tpl.patch
│       └── stats.tpl.patch
├── templates
│   ├── base
│   │   ├── body.tpl.patch
│   │   ├── frame.tpl.patch
│   │   └── theme
│   │       ├── content.css.patch
│   │       ├── cssmenu.css.patch
│   │       ├── design.css.patch
│   │       ├── form.css.patch
│   │       ├── global.css.patch
│   │       ├── login.css.patch
│   │       └── table.css.patch
│   └── default
│       ├── admin
│       │   ├── admin_files_management.tpl.patch
│       │   ├── admin_files_move.tpl.patch
│       │   ├── admin_groups_management2.tpl.patch
│       │   ├── admin_index.tpl.patch
│       │   ├── body.tpl.patch
│       │   ├── frame.tpl.patch
│       │   ├── langs
│       │   │   ├── AdminLangsInstalledListController.tpl.patch
│       │   │   └── AdminLangsNotInstalledListController.tpl.patch
│       │   ├── member
│       │   │   └── AdminExtendedFieldsMemberlistController.tpl.patch
│       │   ├── menus
│       │   │   ├── content.tpl.patch
│       │   │   ├── links.tpl.patch
│       │   │   ├── menu_edition.tpl.patch
│       │   │   ├── menus.tpl.patch
│       │   │   └── menu.tpl.patch
│       │   ├── modules
│       │   │   ├── AdminModuleAddController.tpl.patch
│       │   │   ├── AdminModulesManagementController.tpl.patch
│       │   │   └── AdminModuleUpdateController.tpl.patch
│       │   └── themes
│       │       ├── AdminThemesInstalledListController.tpl.patch
│       │       └── AdminThemesNotInstalledListController.tpl.patch
│       ├── framework
│       │   ├── builder
│       │   │   ├── form
│       │   │   │   ├── FormFieldActionLinkList.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldAuthorizationsSetter.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldCaptcha.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldCheckbox.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldDate.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldLabel.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldMultiLineTextEditor.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldMultipleAutocompleter.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldMultipleFilePicker.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldMultipleSelectChoice.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldPossibleValues.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldset.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormFieldShortMultiLineTextEditor.tpl.patch
│       │   │   │   ├── FormField.tpl.patch
│       │   │   │   └── FormFieldUploadFile.tpl.patch
│       │   │   └── table
│       │   │       └── HTMLTable.tpl.patch
│       │   ├── content
│       │   │   ├── print.tpl.patch
│       │   │   └── syndication
│       │   │       ├── atom.tpl.patch
│       │   │       └── rss.tpl.patch
│       │   ├── groups_auth.tpl.patch
│       │   ├── helper
│       │   │   └── message.tpl.patch
│       │   ├── menus
│       │   │   ├── content.tpl.patch
│       │   │   ├── feed.tpl.patch
│       │   │   ├── links.tpl.patch
│       │   │   └── modules_mini.tpl.patch
│       │   ├── module
│       │   │   ├── admin_module_actions_links_menu.tpl.patch
│       │   │   ├── module_actions_links_menu.tpl.patch
│       │   │   └── module_actions_link.tpl.patch
│       │   └── util
│       │       ├── mini_calendar.tpl.patch
│       │       └── pagination.tpl.patch
│       ├── js_bottom.tpl.patch
│       ├── js_top.tpl.patch
│       └── theme
│           ├── admin_content.css.patch
│           ├── admin_cssmenu.css.patch
│           ├── admin_design.css.patch
│           ├── admin_form.css.patch
│           ├── admin_global.css.patch
│           ├── admin_menus.css.patch
│           ├── admin_table.css.patch
│           └── default.css.patch
├── ThemesSwitcher
│   └── templates
│       ├── themeswitcher.css.patch
│       └── themeswitcher.tpl.patch
├── TinyMCE
│   └── templates
│       └── tinymce_editor.tpl.patch
├── user
│   └── templates
│       ├── moderation_panel.tpl.patch
│       ├── pm.tpl.patch
│       ├── upload_move.tpl.patch
│       ├── upload.tpl.patch
│       ├── UserExploreGroupsController.tpl.patch
│       ├── UserHomeProfileController.tpl.patch
│       └── UserUsersListController.tpl.patch
├── web
│   └── templates
│       ├── web.css.patch
│       ├── WebDisplaySeveralWebLinksController.tpl.patch
│       ├── WebDisplayWebLinkController.tpl.patch
│       ├── web_mini.css.patch
│       └── WebModuleMiniMenu.tpl.patch
└── wiki
    └── templates
        ├── admin_wiki_groups.tpl.patch
        ├── admin_wiki.tpl.patch
        ├── explorer.tpl.patch
        ├── index.tpl.patch
        ├── post.tpl.patch
        ├── property.tpl.patch
        ├── wiki.css.patch
        ├── wiki_js_tools.tpl.patch
        └── wiki.tpl.patch

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